Welcome to VBASE2!
General Information
VBASE2 ID musIGHV057
Class class 1: genomic and rearranged references
Functionality functional gene
V Gene Name(s) v186.2, V186.2, J558.75.177, IGHV1S2*01
V Gene Family VHJ558
Last update 2007-05-17
Nucleotide Sequence
Sequence
Features
Protein Translation
Nucleotide Sequence Structure
FR1 1..75 CDR1 76..99 1st_CYS 64..66
FR2 100..150 CDR2 151..174 CONSERVED_TRP 106..108
FR3 175..288 CDR3 289..>294 2nd_CYS 286..288
Source References
Genomic Sequence
Ensembl: Chr12 (116206085..116205792)
EMBL: AC163348 (14813..15106),   AC160473 (79681..79388),   J00530
EMBL TPA: BN000872
Rearranged Sequence
EMBL: AB159813,   AF045499,   M27788,   M27619,   J00529,   AY246626,   AY035595,   K02792,   AF452668,   AB062569,   AB063214,   AB189969,   AY239762,   AB030763,   AY239820,   AB057819,   Z12772,   M60237,   L16694,   AB058009,   AB067409,   AB058003,   AB121610,   AB160113,   AF028629,   AB058068,   AB058115,   U65772,   AB187313,   AB187397,   AB043437,   AB187463,   AB160140,   X67375,   X67357,   X67356,   AB057897,   AB067410,   AB058091,   AB043436,   AB057906,   AB057904,   AB058108,   AB057989,   AB058028,   AB058049,   AB121582,   AB187457,   U65755,   AB160099,   AB160090,   AB160089,   AB160141,   AB160133,   AB160129,   AB160124,   AB160122,   AB160117,   AB160116,   AF028657,   AB058075,   AB057845,   AB160191,   AB160174,   AB062580,   AB058118,   AB057928,   AB043304,   AB057909,   AB057840,   AB160169,   AF452683,   AB058042,   AB057960,   AB069866,   AB069869,   AB160172,   AB058074,   AB058018,   AB160134,   AB160175,   AB160097,   AB160094,   AB160153,   AB160152,   AB160135,   AB160128,   AB160119,   AB057836,   AB058016,   AB058066,   L16742,   M60241,   AB057923,   AB160177,   AB160166,   AB160146,   AF328110,   AB058034,   AB067440,   AB067432,   AJ307437,   AB069877,   AF028628,   X67349,   X67346,   L16722,   AB067418,   AB057902,   AB057838,   L16729,   AB189976,   AB058022,   AF065374,   AB058002,   AB189977,   L16730,   AB187455,   AB187472,   AB057990,   AB058137,   AB058046,   AB058033,   Z12811,   AB057848,   AB058120,   AB159871,   AB058113,   AB057835,   Z12814,   AB057934,   AB160138,   AB160105,   AB067438,   AB067424,   AB187310,   AB187393,   AB069879,   Z12810,   AB121594,   AB052119,   AB063241,   AF455283,   AB057849,   AB063228,   BC100583,   AB121591,   AB187454,   AB058110,   AF028674,   AB121578,   AB057988,   AB043390,   AB160115,   L16744,   AB121471,   AB121495,   AJ307416,   AJ307415,   AB160149,   M60243,   AB160127,   AB057913,   AB057955,   AB160111,   AB069934,   L16716,   AB160165,   AB069949,   AB069948,   AB069947,   AB069946,   AB069944,   AB069943,   AB069942,   AB069941,   AB069940,   AB069939,   AB069938,   AB069937,   AB069936,   AB069935,   AB069933,   AB069931,   AB069930,   AB069929,   AB069928,   AB069924,   AB069923,   AB069921,   L16717,   AB069957,   AB069956,   AB069955,   AB069954,   AB069953,   AB069952,   AB069951,   AB069950,   AB121569,   L16702,   AF452697,   AF452687,   AJ307423,   AJ307421,   AJ307425,   AB058104,   AJ240369,   AB121516,   AJ240336,   AB121575,   AF028647,   AB160173,   AB058133,   AB057847,   AB121521,   AB057915,   AF028630,   AB160151,   AY035597,   AB058013,   AB160157,   AY035601,   AY035600,   AJ240442,   L16762,   L16754,   L16697,   AB070290,   AF028640,   AB187311,   AB187314,   AB070278,   AB043302,   U65759,   AB121552,   AB070538,   AB187459,   AB052113,   AB058089,   AB058114,   AJ307439,   AJ307438,   AB057879,   AB069862,   AJ307433,   X67344,   AB063223,   AB063215,   AB067793,   AB063231,   X67351,   AJ240439,   X67343,   AJ240371,   AJ240370,   AJ307436,   AJ240457,   AB063221,   AB187413,   AB187444,   AB187428,   AB187422
Cross References
IMGT MMF10123,   MMF101210,   MMB179,   MM49683,   MM49682,   MM32241,   M27789,   AY246694,   AY246653,   AY246652,   AY246651,   AY246650,   AY246648,   AY246643,   AY246642,   AY246641,   AY246640,   AY246639,   AY246638,   AY246636,   AY246632,   AY246626,   AY239937,   AY239840,   AY239838,   AY239837,   AY239836,   AY239820,   AY239766,   AY239765,   AY239764,   AY239763,   AY239762,   AY114422,   AY114414,   AY114378,   AY114373,   AY035621,   AY035601,   AY035600,   AY035597,   AY035595,   AF459856,   AF455993,   AF452697,   AF452696,   AF452691,   AF452687,   AF452683,   AF452675,   AF452668,   AF328110,   AF328096,   AF328076,   AF312460,   AF312457,   AF312436,   AF296429,   AF146320,   AF065374,   AF045499,   AF045489,   AF028674,   AF028657,   AF028654,   AF028647,   AF028640,   AF028632,   AF028630,   AF028629,   AF028628,   AF028625,   AF028620,   AF028613,   AB189978,   AB189977,   AB189976,   AB189975,   AB189974,   AB189973,   AB189972,   AB189971,   AB189970,   AB189969,   AB187476,   AB187475,   AB187474,   AB187473,   AB187472,   AB187467,   AB187466,   AB187465,   AB187463,   AB187459,   AB187458,   AB187457,   AB187455,   AB187454,   AB187453,   AB187452,   AB187449,   AB187448,   AB187446,   AB187445,   AB187444,   AB187443,   AB187441,   AB187437,   AB187431,   AB187430,   AB187428,   AB187427,   AB187425,   AB187424,   AB187422,   AB187420,   AB187413,   AB187411,   AB187408,   AB187405,   AB187403,   AB187400,   AB187399,   AB187397,   AB187396,   AB187395,   AB187394,   AB187393,   AB187392,   AB187391,   AB187390,   AB187387,   AB187385,   AB187384,   AB187383,   AB187340,   AB187315,   AB187314,   AB187313,   AB187312,   AB187311,   AB187310,   AB187287,   AB164014,   AB163982,   AB160825,   AB160824,   AB160645,   AB160574,   AB160502,   AB160434,   AB160328,   AB160192,   AB160191,   AB160190,   AB160188,   AB160187,   AB160186,   AB160184,   AB160182,   AB160179,   AB160178,   AB160177,   AB160175,   AB160174,   AB160173,   AB160172,   AB160169,   AB160168,   AB160166,   AB160165,   AB160164,   AB160163,   AB160162,   AB160161,   AB160157,   AB160154,   AB160153,   AB160152,   AB160151,   AB160149,   AB160148,   AB160147,   AB160146,   AB160145,   AB160143,   AB160141,   AB160140,   AB160139,   AB160138,   AB160135,   AB160134,   AB160133,   AB160129,   AB160128,   AB160127,   AB160124,   AB160122,   AB160119,   AB160118,   AB160117,   AB160116,   AB160115,   AB160114,   AB160113,   AB160111,   AB160110,   AB160108,   AB160105,   AB160102,   AB160100,   AB160099,   AB160097,   AB160095,   AB160094,   AB160093,   AB160092,   AB160091,   AB160090,   AB160089,   AB159955,   AB159871,   AB159856,   AB159813,   AB121659,   AB121658,   AB121631,   AB121629,   AB121615,   AB121613,   AB121610,   AB121608,   AB121601,   AB121597,   AB121594,   AB121592,   AB121591,   AB121588,   AB121586,   AB121582,   AB121578,   AB121577,   AB121575,   AB121573,   AB121569,   AB121565,   AB121557,   AB121554,   AB121552,   AB121551,   AB121541,   AB121537,   AB121535,   AB121530,   AB121525,   AB121521,   AB121520,   AB121517,   AB121516,   AB121513,   AB121507,   AB121495,   AB121471,   AB067797,   AB067796,   AB067795,   AB067794,   AB067793,   AB067791,   AB067789,   AB067788,   AB067787,   AB067785,   AB067783,   AB067782,   AB067781,   AB067440,   AB067439,   AB067438,   AB067437,   AB067434,   AB067433,   AB067432,   AB067429,   AB067426,   AB067425,   AB067424,   AB067422,   AB067419,   AB067418,   AB067417,   AB067410,   AB067409,   AB063243,   AB063241,   AB063238,   AB063237,   AB063234,   AB063231,   AB063228,   AB063226,   AB063225,   AB063224,   AB063223,   AB063222,   AB063221,   AB063220,   AB063218,   AB063216,   AB063215,   AB063214,   AB062580,   AB062569,   AB058194,   AB058193,   AB058192,   AB058190,   AB058187,   AB058186,   AB058184,   AB058183,   AB058182,   AB058178,   AB058175,   AB058173,   AB058172,   AB058170,   AB058169,   AB058161,   AB058159,   AB058158,   AB058157,   AB058153,   AB058148,   AB058142,   AB058141,   AB058139,   AB058137,   AB058136,   AB058134,   AB058133,   AB058124,   AB058123,   AB058121,   AB058120,   AB058118,   AB058117,   AB058115,   AB058114,   AB058113,   AB058110,   AB058108,   AB058107,   AB058104,   AB058103,   AB058091,   AB058089,   AB058084,   AB058078,   AB058075,   AB058074,   AB058070,   AB058068,   AB058067,   AB058066,   AB058065,   AB058064,   AB058063,   AB058062,   AB058060,   AB058051,   AB058049,   AB058046,   AB058042,   AB058041,   AB058039,   AB058035,   AB058034,   AB058033,   AB058031,   AB058029,   AB058028,   AB058027,   AB058026,   AB058024,   AB058022,   AB058018,   AB058016,   AB058014,   AB058013,   AB058010,   AB058009,   AB058008,   AB058007,   AB058003,   AB058002,   AB057999,   AB057997,   AB057996,   AB057990,   AB057989,   AB057988,   AB057987,   AB057982,   AB057981,   AB057978,   AB057977,   AB057960,   AB057955,   AB057951,   AB057949,   AB057948,   AB057945,   AB057934,   AB057932,   AB057931,   AB057930,   AB057928,   AB057925,   AB057923,   AB057919,   AB057916,   AB057915,   AB057914,   AB057913,   AB057909,   AB057906,   AB057904,   AB057902,   AB057897,   AB057891,   AB057879,   AB057878,   AB057864,   AB057851,   AB057849,   AB057848,   AB057847,   AB057846,   AB057845,   AB057843,   AB057841,   AB057840,   AB057839,   AB057838,   AB057837,   AB057836,   AB057835,   AB057826,   AB057825,   AB057820,   AB057819,   AB052121,   AB052120,   AB052119,   AB052118,   AB052116,   AB052115,   AB052114,   AB052113,   AB052112,   AB044819,   AB044815,   AB044814,   AB044813,   AB044812,   AB044808,   AB043438,   AB043437,   AB043436,   AB043426,   AB043418,   AB043416,   AB043411,   AB043409,   AB043405,   AB043400,   AB043390,   AB043311,   AB043304,   AB043303,   AB043302,   AB043298,   AB043288,   AB043287,   AB043286,   AB043284,   AB043280,   AB043275,   AB043274,   AB043265,   AB043264,   AB043233,   AB043230,   AB043229,   AB043182,   AB043156,   AB043150,   AB043148,   AB030763
KABAT (ftp KABAT) KABID_035564,   KABID_035563,   KABID_035561,   KABID_035560,   KABID_035559,   KABID_035558,   KABID_035557,   KABID_035556,   KABID_035548,   KABID_035546,   KABID_035542,   KABID_035540,   KABID_031222,   KABID_031206,   KABID_031204,   KABID_031202,   KABID_031200,   KABID_031197,   KABID_028389,   KABID_028388,   KABID_028387,   KABID_028386,   KABID_027484,   KABID_027483,   KABID_023890,   KABID_023889,   KABID_023888,   KABID_023885,   KABID_023877,   KABID_023876,   KABID_023875,   KABID_023874,   KABID_023873,   KABID_023872,   KABID_023871,   KABID_023870,   KABID_023869,   KABID_023850,   KABID_023849,   KABID_023848,   KABID_023847,   KABID_023846,   KABID_023845,   KABID_023844,   KABID_023843,   KABID_023842,   KABID_023841,   KABID_023840,   KABID_023839,   KABID_023838,   KABID_023837,   KABID_023836,   KABID_023835,   KABID_023834,   KABID_023833,   KABID_023832,   KABID_023831,   KABID_023830,   KABID_023829,   KABID_023818,   KABID_023817,   KABID_023816,   KABID_023815,   KABID_023814,   KABID_023813,   KABID_023812,   KABID_023811,   KABID_023810,   KABID_023809,   KABID_023808,   KABID_019387,   KABID_003401,   KABID_002148,   KABID_002136,   KABID_002135,   KABID_002134,   KABID_002133,   KABID_002132,   KABID_002131,   KABID_002130,   KABID_002127,   KABID_002126,   KABID_002125,   KABID_002124,   KABID_002123,   KABID_002122,   KABID_002121,   KABID_002120,   KABID_002119,   KABID_002118,   KABID_002117,   KABID_002116,   KABID_002115,   KABID_002114,   KABID_002113,   KABID_002112,   KABID_002111,   KABID_002110,   KABID_002109,   KABID_002108,   KABID_002107,   KABID_002106,   KABID_002105,   KABID_002104,   KABID_002103,   KABID_002102,   KABID_002101,   KABID_002100,   KABID_002099,   KABID_002098,   KABID_002097,   KABID_002096,   KABID_002095,   KABID_002094,   KABID_002093,   KABID_002092,   KABID_002091,   KABID_002090,   KABID_002089,   KABID_002088,   KABID_002087,   KABID_002086,   KABID_002085,   KABID_002084,   KABID_002082,   KABID_002081,   KABID_002080,   KABID_002079,   KABID_001878,   KABID_001853,   KABID_001852,   KABID_001851,   KABID_001850,   KABID_001849,   KABID_001848,   KABID_001847,   KABID_001846,   KABID_001845,   KABID_001823,   KABID_001822,   KABID_001819,   KABID_001818,   KABID_001817,   KABID_001816

Back New Query
Up
© 2003-2008
by Ida Retter,
Svetlana Mollova
and Werner Müller
Last Database Update:
2006-07-06
Contact:
info@vbase2.org
Hosted by:
EU-GENE
sponsored by
ABcheck AbCheck